لا تخلو المحاسبة الإلكترونية من العيوب ومنها الأخطاء الفنية، وتكلفة التثبيت والصيانة، والتهديد بالإختراق. تُستخدم تقنيات التشفير لتأمين البيانات أثناء نقلها أو تخزينها. يتم تحويل المعلومات المالية إلى صيغة مشفرة غير مفهومة إلا من قبل الأطراف المصرح لها. في نظام المحاسبة التقليدي، يتم إعداد البيان المالي في نهاية السنة https://travis2i43w.csublogs.com/39825029/المحاسبة-الالكترونية-an-overview